Порядок уплаты НДФЛ зависит не только от наличия у физического лица статуса индивидуального предпринимателя, но и от вида выплачиваемого дохода и, соответственно, налогового статуса организации - источника его выплаты.
   Поэтому, если организация выплачивает индивидуальному предпринимателю доходы, получение которых не связано с его предпринимательской деятельностью и (или) в отношении которых организация - источник выплаты дохода в соответствии с гл. 23 НК РФ является налоговым агентом, обязанность по уплате НДФЛ исполняет такая организация - налоговый агент.
   Об этом Минфин сообщил в Письме от 03.10.2008 N 03-04-06-01/288.